Choki Motobu s-a nascut in satul Akahira din regiunea Shuri, Okinawa. Era fiul lui Motobu Udun, de escendenta nobila. Motobu a invatat cateva tehnici de la familie, dar cum doar
fratele sau mai mare, Choyu, avea dreptul de a continua traditia martiala a familiei, a trebuit sa caute altundeva ocazia de a studia.
Choki a inceput sa se antreneze mult la makiwara si obisnuia sa ridice pietre grele pentru a castiga forta.
Si-a propus sa devina cat mai puternic si mai bun si s-a dedicat unor serii de antrenament dure. In curand a devenit cunoscut cu porecla "Motobu zaru", "Motobu maimuta" datorita vitezei sale si agilitatii deosebite. In cele din urma a devenit studentul lui Anko Itosu.
Tanarul Choki isi petrecea o mare parte din timp provocand la bataie barbatii puternici si aratosi care ii aparea in cale. A invatat mult din aceste lupte de strada, pe care in majoritate le castiga.
Activitatea "extrascolara" a tanarului discipol i-a displacut insa lui Itosu, care l-a expulzat din dojo.Comportamentul agresiv al lui Motobu i-a adus o reputatie negativa si in curand o serie de sensei aveau sa-l refuze atunci cand incerca sa li se alature. A existat insa cineva caruia nu i-a displacut spiritul combativ al tanarului si l-a primit ca discipol. Acesta era Kosaku Matsumora din Tomari. Aici Motobu a invat o serie de kata, dar si-a pastrat vechea ocupatie de "street fighter".
Matsumora a refuzat in cele din urma sa-l invete kumite, dar se spune ca studentul privea unele atrenamente realizate de maestru printr-o spartura in gard.
Calitatile sale dobandite datorita multelor lupte i-au folosit si a inceput sa-si formuleze propriul stil de kumite, reusind sa atraga atentia atat in Okinawa cat si in Japonia. Intr-o zi, aflandu-se in Kyoto, a fost convins de un prieten sa participe la un concurs. Exista un boxer strain care ii provoca la lupta pe cei doritori. Boxerul s-a comportat arogant, dar timp de 2 runde Motobu s-a multumit doar sa eschiveze. Infuriat in cele din urma i-a aplicat acestuia o lovitura de pumn in tampla si l-a lasat K.O. Multimea a incremenit, pentru ca inca nu vazusera un asemenea stil. Cu toate ca tehnica pe care a aplicat-o a fost una de baza, Motobu a castigat o reputatie deosebita si s-a trezit peste noapte maestru.
In scurt timp a devenit o persoana extrem de respectata si a fost invitat sa ii invete pe studentii de la diferite universitati. Multi alti sensei aveau sa isi trimita studentii pe la Motobu pentru a invata ceva din uimitorul sau stil de lupta. Se spune ca ii invata pe studentii sai kata Naihanchi si o serie de tehnici de aruncare si de prize. Se spune ca Choki Motobu, plin de incredere datorita realizarilor sale l-ar fi provocat pe fratele sau mai mare, Choyu.
Acesta l-ar fi azvarlit pe Motobu ca pe o papusa de carpe si acesta a devenit dintr-o data mai umil, adoptand in acelasi timp mai multe din formele Ti, specifice stilului familiei sale.
In 1922 Maestrul Motobu il ajuta pe Maestrul Funakoshi in activitatea sa de a-i invata karate pe tinerii japonezi. Cu noi teluri, Motobu se intoarce in Okinawa si in anul 1936 incepe sa se antreneze alaturi de Maestrul Kentsu Yabu.
Mai tarziu, Motobu si-a dat seama de importanta traditiei in antrenament. A sustinut mereu antrenamentul cu makiwara si a devenit pasionat de kata, la fel de entuziast in aceasta chestiune pe cat a fost de kumite in tinerete. Pentru o scurta perioada a plecat din Tokyo si s-a intors in Okinawa pentru a-si vizita maestrii si pentru a se asigura ca la randul sau ii invata pe studenti kata corecte.
S-a intors apoi in Tokyo continuand activitatea cu discipolii sai. La scurt timp inainte de cel de-al doilea Razboi Mondial, maestrul Motobu a revenit in Okinawa. A murit in 1944 din cauza unei boli la stomac.